今更ですが、MT3.33へアップグレードしました。以下メモ。
DBのバックアップ（念のため）
ディレクトリを展開。ディレクトリをmt333へ。
/htdocs/mt333/
mt-staticを mt-static333としてDocumentRootへコピー。
/htdocs/mt-static333
mt-config.cgiをコピー。mt-config.cgiを適宜変更。
pluginsをコピー。
新しいmt.cgiへアクセス。
DBのアップグレードはないため特に問題なし。
mt-config.cgiを変更したので再構築。
今回アップグレードした動機は、トラックバック送信先のURLに記述したURLを削除して「保存」を押しても削除できない不具合が直っているため。
以上。
追記）
mt-staticディレクトリにアクセスにいくものがあるため、
$ ln -s mt-static333 mt-static
としてリンクを作成。themesも旧mt-staticからコピー