auの携帯、ソニーエリクソンW43S利用を例にしてお話します。もしかしたら他の携帯では動作が異なるかもしれませんが、おそらく違わないかと。
[の] のまのしわざ: トラックバック地図に自動pingするLocationLinkプラグイン
GPSから直接得られた情報を付加した場合の測地系は世界測地系(wgs84)となります。
しかし地図を開いて位置を手動で修正した場合は測地系が日本測地系(Tokyo)になります。
これは修正に利用する地図の測地系がTokyoになっているためだと思われますが、ちょっとトリッキーなポイントですね。ezweb地図へのリンクはきちんと引数 datum=0/1で判別されているので表示は問題ないです。
http://walk.eznavi.jp/map/?datum=0&unit=0&lat=%2b35.37.21.07&lon=%2b139.43.07.14&fm=0
http://walk.eznavi.jp/map/?datum=1&unit=0&lat=%2b35.40.23.62&lon=%2b139.44.10.05&fm=0
建物の中や街中などではほとんど衛星がとれません。そのため随分と誤差が出てしまうのですがこれを修正するのが時間的に出来ないことがあります。それでもだいたいの位置が分かっているのでないよりもあったほうがいいです。
そうなると携帯以外で修正する手段が欲しいのですが、それについてはまた機会があれば。